v1 - Revision 103783: /trunk/c++/src/algo/blast/core

• ..
• CMakeLists.blast.lib.txt
• CMakeLists.blast.objs.txt
• CMakeLists.txt
• Makefile.blast.lib
• Makefile.blast.lib.unix
• Makefile.in
• README
• aa_ungapped.c
• blast_aalookup.c
• blast_aascan.c
• blast_diagnostics.c
• blast_dynarray.c
• blast_dynarray.h
• blast_encoding.c
• blast_engine.c
• blast_extend.c
• blast_filter.c
• blast_gapalign.c
• blast_gapalign_priv.h
• blast_hits.c
• blast_hits_priv.h
• blast_hspstream.c
• blast_hspstream_mt_utils.c
• blast_hspstream_mt_utils.h
• blast_itree.c
• blast_itree.h
• blast_kappa.c
• blast_lookup.c
• blast_message.c
• blast_nalookup.c
• blast_nascan.c
• blast_options.c
• blast_parameters.c
• blast_posit.c
• blast_posit.h
• blast_program.c
• blast_psi.c
• blast_psi_priv.c
• blast_psi_priv.h
• blast_query_info.c
• blast_seg.c
• blast_seqsrc.c
• blast_setup.c
• blast_stat.c
• blast_sw.c
• blast_traceback.c
• blast_traceback_mt_priv.c
• blast_traceback_mt_priv.h
• blast_tune.c
• blast_util.c
• boost_erf.c
• boost_erf.h
• gapinfo.c
• gencode_singleton.c
• greedy_align.c
• hspfilter_besthit.c
• hspfilter_collector.c
• hspfilter_culling.c
• hspfilter_mapper.c
• index_ungapped.c
• index_ungapped.h
• jumper.c
• jumper.h
• link_hsps.c
• lookup_util.c
• lookup_wrap.c
• masksubj.inl
• matrix_freq_ratios.c
• matrix_freq_ratios.h
• na_ungapped.c
• ncbi_erf.c
• ncbi_math.c
• ncbi_std.c
• pattern.c
• pattern_priv.h
• phi_extend.c
• phi_gapalign.c
• phi_lookup.c
• spliced_hits.c
• split_query.c